齐以涛

一、个人简介

科研成果

齐以涛，博士，博士生导师，陕西省百人计划特聘教授。2007年7月毕业于中国农业大学获得博士学位。2007年8月至2012年7月在美国德州心脏研究所（Texas Heart Institute）从事博士后研究，2017年8月至2014年12月在美国德州心脏研究所任Research associate。2015年1月至今任买球平台官方网站教授，主要研究蛋白质的SUMO修饰参与发育和疾病发生发展的分子机制，相关研究成果以第一或通讯作者身份在Mol Cell、Neuron、Cell Death Differ、Int J Biol Macromol和J Biol Chem等杂志发表研究论文50余篇，并获得美国MD Anderson Cancer Center“杰出论文奖”。研究成果得到了许多国际主流媒体的关注和报道，包括ScienceDaily和EurekAlert等。已申请发明专利1项，发表学术著作1部，获得多项国家和陕西省自然科学基金项目的资助。

讲授课程

本科生：细胞生物学、细胞生物学实验、蛋白质工程、细胞信号转导

研究生：高级细胞生物学、高级生物化学与分子生物学、分子细胞生物学、细胞蛋白质研究方法、表观遗传学

学术兼职

中国病理生理学会蛋白质修饰与疾病专业委员会委员，中国毒理学会兽医毒理学分会委员，陕西省基因组与健康学会副理事长，陕西省细胞生物学学会理事，陕西省研究型医院学会细胞治疗专业委员会常务委员，陕西省脑疾病细胞分子医学专业委员会委员。Biotechnology letters, Bosnian journal of basic medical sciences, Current proteomics, Molecular and cellular biochemistry等期刊编委，Apoptosis, Breast cancer research and treatment, Cell and bioscience, Food and chemical toxicology等期刊审稿人。

二、主要研究领域及兴趣

SUMO修饰（SUMOylation）是一种和泛素化修饰类似的蛋白质修饰形式，影响其所修饰的蛋白质功能与定位的一个关键性调节机制。它参与调节多种细胞生命活动过程，包括细胞周期、细胞分裂、DNA损伤修复、细胞内转运、调节蛋白稳定和基因转录等。SUMO修饰是一个动态可逆的过程，由SUMO特异的活化酶（E1）、结合酶（E2）和连接酶（E3）相继作用来催化完成，其去SUMO修饰的过程（De-SUMOylation）则是由SUMO特异性蛋白酶家族（SENP）来完成。本实验室主要研究蛋白质的SUMO修饰, 特别是由SENP2介导的去SUMO修饰过程和对细胞信号转导的调控机制，以及它们在发育与疾病过程中的作用与意义。主要研究领域有:

1. SENP2的靶蛋白分子与生物学功能

SENP2的功能是通过对靶蛋白质的去SUMO化，来改变靶蛋白的活性来实现的。因此，研究SENP2的生物学功能，首先要鉴定SENP2的靶蛋白分子。我们通过功能性筛选和基因敲除等策略来寻找和鉴定SENP2的靶蛋白质，并研究SENP2调控靶蛋白的作用与机制，从而来明确SENP2的生物学功能。

2. 调控SENP2的细胞信号网络

SENP2的去SUMO化参与了许多细胞生命活性过程，也会受到细胞信号网络的调控。因此我们在鉴定SENP2靶蛋白的基础上，研究细胞信号通路对这一去SUMO化过程的调节作用与机制，并依此建立SENP2的细胞信号调控网络。

3. SENP2在发育与疾病中的作用与意义

SUMO修饰的靶蛋白分子与发育和疾病有密切的关系，因此SENP2通过这些靶蛋白分子的去SUMO化修饰，必将参与对发育和疾病的调控。我们利用细胞、模式动物及疾病标本，综合运用分子、细胞和发育生物学以及病理学的知识与手段，研究蛋白质的SUMO修饰在发育与疾病过程中的作用机制，为医学实践提供理论基础。

三、承担的科研项目

1.陕西省自然科学基金重点项目“解旋酶样转录因子HLTF的SUMO修饰调控急性髓系白血病进程的作用机制”（2024JC-ZDXM-12，2024.1-2026.12）

2.中央高校基本科研业务费科技领军团队项目“蛋白质动态SUMO修饰参与急性髓系白血病进程的机制研究”（GK202202006，2022.1-2024.12）

3.主持国家自然科学基金面上项目“SUMO特异性蛋白酶3调控小鼠胚胎心脏发育的机制研究”（ 81870241，2019.1-2022.12）

4.主持国家自然科学基金面上项目“SUMO修饰调控Kv7.2/Kv7.3钾离子通道蛋白活性引起癫痫猝死的机制研究”（81671294，2017.1-2020.12）

5.主持陕西省自然科学基金面上项目“SUMO修饰影响迷走神经活性引起癫痫猝死的机制研究”（2017JM3013，2017.1-2018.12）

6.主持中央高校基本科研业务费自由探索项目“SENP2调控M电流的机制研究”，（GK201603061，2016.1-2017.12）

四、代表性论文

1. Xu Chen, Qi Su, Xing Ling, Yanyan Yang, Yuhang Liu, Xinjie Zhu, Anqi He, Hongmei Wu, Yitao Qi. SENP3-regulated Nodal signaling plays a potential role in cardiac left-right asymmetry development. International journal of biological macromolecules. 2024. 274(Pt 2):133294.

2. Xu Chen, Danqing Li, Qi Su, Xing Ling, Siyu Ding, Runxiao Xu, Zhaoxia Liu, Yuanyuan Qin, Jinping Zhang, Zhihui Yang, Xunlei Kang, Yitao Qi, Hongmei Wu. MicroRNA-145-5p inhibits the tumorigenesis of breast cancer through SENP2-regulated ubiquitination of ERK2. Cellular and molecular life sciences. 2024. 81(1):461.

3. Xu Chen, Danqing Li, Qi Su, Xing Ling, Yanyan Yang, Yuhang Liu, Xinjie Zhu, Anqi He, Siyu Ding, Runxiao Xu, Zhaoxia Liu, Xiaojun Long, Jinping Zhang, Zhihui Yang, Yitao Qi, Hongmei Wu. SENP3 mediates the deSUMOylation and degradation of YAP1 to regulate the progression of triple-negative breast cancer. Journal of biological chemistry. 2024. 300(10):107764.

4. Xu Chen, Qi Su, Ruize Gong, Xing Ling, Runxiao Xu, Qijia Feng, Jialiang Ke, Meng Liu, Gulipiyanmu Kahaerjiang, Yuhang Liu, Yanyan Yang, Zhihong Jiang, Hongmei Wu, Yitao Qi. LC3-associated phagocytosis and human diseases: Insights from mechanisms to therapeutic potential. The FASEB journal. 2024. 38(20):e70130.

5. Qi Su, Xu Chen, Xing Ling, Danqing Li, Xiang Ren, Yang Zhao, Yanyan Yang, Yuhang Liu, Anqi He, Xinjie Zhu, Xinyi Yang, Wenbin Lu, Hongmei Wu, Yitao Qi. SUMOylation of Smad2 mediates TGF-β-regulated endothelial-mesenchymal transition. Journal of biological chemistry. 2023. 299(10):105244.

6. Xu Chen, Yuanyuan Qin, Yuhong Zhang, Xinyi Yang, Zhengcao Xing, Yajie Shen, Jinke Cheng, Edward Yeh, Hongmei Wu, Yitao Qi. SENP2-PLCβ4 signaling regulates neurogenesis through the maintenance of calcium homeostasis. Cell death and differentiation. 2022. 29(2):337-350.

7. Yajie Shen, Jingqi Zhou, Kui Nie, Shuhua Cheng, Zhengming Chen, Wenhan Wang, Weiqing Wei, Daiji Jiang, Zijing Peng, Yizhuo Ren, Yirong Zhang, Qiuju Fan, Kristy L. Richards, Yitao Qi, Jinke Cheng, Wayne Tam, Jiao Ma. Oncogenic role of SOX9-DHCR24-cholesterol biosynthesis axis in IGH-BCL2 positive diffuse large B-cell lymphomas. Blood. 2022.139(1):73-86.

8. Xu Chen, Yuhong Zhang, Xiang Ren, Qi Su, Yan Liu, Xing Dang, Yuanyuan Qin, Xinyi Yang, Zhengcao Xing, Yajie Shen, Yaya Wang, Zhantao Bai, Edward T.H. Yeh, Hongmei Wu, Yitao Qi. The SUMO-specific protease SENP2 plays an essential role in the regulation of Kv7.2 and Kv7.3 potassium channels. Journal of biological chemistry. 2021. 297(4):101183(1-14).

9. Yuhong Zhang, Xu Chen, Qiqi Wang, Congcong Du, Wenbin Lu, Hong Yuan, Zhenzhen Zhang, Danqing Li, Xing Ling, Xiang Ren, Yang Zhao, Qi Su, Zhengcao Xing, Yuanyuan Qin, Xinyi Yang, Yajie Shen, Hongmei Wu, Yitao Qi. Hyper-SUMOylation of SMN induced by SENP2 deficiency decreases its stability and leads to spinal muscular atrophy-like pathology. Journal of molecular medicine. 2021. 99(12):1797-1813.

10. Xu Chen, Yuhong Zhang, Qiqi Wang, Yuanyuan Qin, Xinyi Yang, Zhengcao Xing, Yajie Shen, Hongmei Wu, Yitao Qi. The function of SUMOylation and its crucial roles in the development of neurological diseases. The FASEB journal. 2021. 35(4): e21510(1-17).

11. Biying Zhao, Zhenzhen Zhang, Xu Chen, Yajie Shen, Yuanyuan Qin, Xinyi Yang, Zhengcao Xing, Shanshan Zhang, Xiaojun Long, Yuhong Zhang, Siming An, Hongmei Wu, Yitao Qi. The important roles of protein SUMOylation in the occurrence and development of leukemia and clinical implications. Journal of cellular physiology. 2021. 236(5): 3466-3480.

12. Jianli He, Xun Shangguan, Wei Zhou, Ying Cao, Quan Zheng, Jun Tu, Gaolei Hu, Zi Liang, Cen Jiang, Liufu Deng, Shengdian Wang, Wen Yang, Yong Zuo, Jiao Ma, Rong Cai, Yalan Chen, Qiuju Fan, Baijun Dong, Wei Xue, Hongsheng Tan, Yitao Qi, Jianmin Gu, Bing Su, Y Eugene Chin, Guoqiang Chen, Qi Wang, Tianshi Wang, and Jinke Cheng. Glucose limitation activates AMPK coupled SENP1-Sirt3 signalling in mitochondria for T cell memory development. Nature Communications. (2021)12(1): 4371: 1-14.

13. Xu Chen, Shanshan Zhang, Jifang Huang, Wanying Dong, Hui Xiao, Huanjie Shao, Jinke Cheng, Hongmei Wu, Yitao Qi. Hyper-SUMOylation of K⁺ channels in sudden unexplained death in epilepsy: Isolation and primary culture of dissociated hippocampal neurons from newborn mice for subcellular localization. Methods in molecular biology. 2018. 1684: 63-71.

14. Hongmei Wu, Xu Chen, Jinke Cheng, Yitao Qi. SUMOylation and Potassium Channels: Links to Epilepsy and Sudden Death. Advances in Protein Chemistry and Structural Biology. 2016. 103: 295-321.

15. Yitao Qi, Jingxiong Wang, Valerie C. Bomben, Depei Li, Shaorui Chen, Hao Sun, Yutao Xi, John G. Reed, Jinke Cheng, Huilin Pan, Jeffrey L. Noebels, Edward T.H. Yeh. Hyper-SUMOylation of the Kv7 potassium channel abolishes the M current leading to seizures and sudden death. Neuron. 2014. 83(5): 1159-1171.

16. Yitao Qi, Yong Zuo, Edward T.H. Yeh, Jinke Cheng. SUMO-specific protease 2 is essential for myostatin expression and myogenesis. Journal of Biological Chemistry. 289(6) (2014): 3288-3293.

17. Xunlei Kang, Yitao Qi*, Yong Zuo, Qi Wang, Yanqiong Zou, Robert J. Schwartz, Jinke Cheng, Edward T.H. Yeh. (*equal contribution). SUMO-Specific Protease 2 is essential for suppression of polycomb group proteins mediated gene silencing during embryonic development. Molecular cell. 2010. 38: 191-201.